MilletDB：谷子数据库

谷子数据库是基于深圳华大基因研究院和张家口市农业科学院等单位谷子基因组研究项目数据设计，该数据库创新的将谷子的表型和基因型贯穿起来，通过谷子的表型信息可以查询和检索谷子的基因型信息，通过基因型可以查到对应的表型信息。数据库的另一个特色是基于生物大数据的技术，利用数据库2000多份谷子材料，记录的40种左右的谷子表型信息，利用机器学习方法（包括K近邻， 随机森林和支持向量机算法等）针对上述基因型和表型的数据建立模型。模型最终实现从品种的基因型来预测品种表型，助力于智能分子育种。

发布于 2013-06-23

Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. et al. Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012). DOI: 10.1038/nbt.2195