ZESTA：斑马鱼胚胎发育时空图谱

斑马鱼胚胎发育时空图谱（ZESTA）利用Stero-seq技术分析了斑马鱼胚胎发育过程中基因表达和调控网络的时空动态。该数据库分析了91个胚胎切片，涵盖了发育的前24小时内的6个关键时间点，获得了10x10x15µm3（接近细胞大小）分辨率的152,977个点的空间坐标。 同时确定了特定组织组织的空间模块和共变基因。通过对各时间点的Stereo-seq和scRNA-seq数据进行综合分析，重建了斑马鱼胚胎发生过程中细胞命运转变和分子变化的空间解析发展轨迹。

发布于 2022-05-04

Liu, C., Li, R., Li, Y., Lin, X., Zhao, K., Liu, Q., ... & Liu, L. (2022). Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis. Developmental Cell, 57(10), 1284-1298. DOI: 10.1016/j.devcel.2022.04.009