海外赛道首发,15W+奖金池!2024『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛-欧洲·算法赛火热报名中
由深圳国家基因库、华大生命科学研究院、国际数据委员会共同发起,华大基因和华大智造主办的2024『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛- 欧洲·算法赛(2024 MICOS-EU)已于4月启动。
2024 MICOS-EU将『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛扩展到更广泛的全球社区,聚焦科研热点时空组,旨在有效解决空间转录组数据聚类算法的准确性和效率问题。
目前2024 MICOS-EU正在火热报名中,获奖队伍将瓜分2W+美金(约15W+人民币)奖金池,优秀参赛者有机会获得面试推荐和全额奖学金机会。欢迎多领域背景人才加入2024 MICOS-EU!
访问赛事官网了解赛事详情及报名:https://micos.cngb.org/europe/
2024『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛-欧洲 算法赛
『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛(MICOS)是由深圳国家基因库等单位共同发起的,面向高校、科研院所、企业等机构多学科背景人才的国际赛事,旨在深入聚焦生命科学行业发展的新动态、新趋势、新技术,促进生命科学领域创新发展。
此前『猛犸杯』聚焦生命科学领域科研及产业热点已成功主办三届创新大赛,2024『猛犸杯』国际生命科学数据创新大赛-欧洲·算法赛(2024 MICOS-EU)将MICOS扩展到更广泛的全球社区。本届大赛由深圳国家基因库、华大生命科学研究院、国际数据委员会共同发起,华大基因和华大智造主办,贝尔格莱德大学电气工程学院、塞尔维亚分子遗传学与基因工程研究所协办,旨在有效解决空间转录组数据聚类算法的准确性和效率问题。
海外决赛
在线评分前六名选手将受邀前往塞尔维亚参加线下决赛活动,分别争夺一、二、三等奖及优秀奖。
* 主办方将承担不高于500美元的机票及在塞食宿
奖学金&面试机会
优秀的选手还有机会获得面试推荐机会、BGI-college提供的全额奖学金支持。
赛题设置
赛题背景
空间转录组学因其对多组学数据的大数据分析的巨大价值而被《自然方法》杂志评为 2020 年度最佳方法。它通过提供组织或生物体内的空间解析基因表达信息,在组学研究和数据科学的众多应用中发挥着至关重要的作用。该技术能够将转录组数据与其他组学数据(例如基因组学、蛋白质组学和代谢组学)集成,并结合图像和视频数据进行关联,以获得对生物系统的全面了解。
然而,空间转录组数据集的特点给数据分析带来了一系列挑战。首先,这些数据往往具有较高的维度,这意味着样本相对较少,但特征数量较多,导致直观理解数据的复杂性和难度。其次,不同的组学数据在测量方法、数据结构和数据类型上表现出显著的异质性。多组学数据集(包括空间转录组数据)的高维性、异质性、互补性和一致性给数据分析带来了挑战。
因此,主办方希望利用聚类算法对空间转录组数据进行优化和整合,增强数据分析的有效性和可解释性,进一步推动生物医学研究的发展和应用。
赛题详情
为有效解决空间转录组数据聚类算法的准确性和效率问题,主办方将为参赛者提供“.gem.gz”格式的空间转录组基因表达数据、原始HE图像和细胞分割掩码文件。参与者应应用/改进/开发适合整合转录组数据和HE图像数据的预处理和聚类算法,同时确保分析结果的准确性。目标是减少算法的计算内存消耗并提高计算速度。目标的实现将通过聚类结果的空间可视化和相关评价指标来确定。
赛题数据
https://db.cngb.org/stomics/datasets/STDS0000240
大赛日程
赛事发布
2024.03-04 发布赛事及赛题介绍
预赛
2024.04-05 赛事预赛(在线评分)
复赛
2024.05-06 赛事复赛(在线评分)
评审
2024.06 作品评估及代码审核
决赛
2024.06.19 赛事决赛。决赛地点:塞尔维亚
参赛条件
面向全球招募,不限年龄、国籍,高校、科研院所、企业从业人员等均可报名参赛。
* 参赛人员应当保证所提交身份信息的真实性,每名参赛人员仅允许加入1支参赛队伍。
参赛流程
访问赛事官网(https://micos.cngb.org/europe/),点击Sign up now → 进入赛事平台(https://www.datacontest.net/v3/cmptDetail.html?id=878),点击MICOS 2024 in Europe: Algorithms Analysis of Multi-omics → 进入赛事详情页,点击Join Competition,加入大赛。
赛事官网首页已更新赛题培训视频,参赛者可点击查看,关于赛事的任何问题都可联系官方邮箱咨询:P_MICOS@cngb.org.
赛事组织机构
发起单位
深圳国家基因库、华大生命科学研究院、国际数据委员会
主办单位
华大基因、华大智造
协办单位
贝尔格莱德大学电气工程学院、塞尔维亚分子遗传学与基因工程研究所
会议合作
贝尔格莱德生物信息学会议 BelBi2024
*大赛组委会保留对本次大赛的最终解释权。