Screening of cell-virus, cell-cell, gene-gene interactions among kingdoms of life at single cell resolution
Source: CNGBdb Project (ID CNP0002081)
CC BY 4

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Description: 严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的爆发对全球健康构成了重大而紧迫的威胁。 SARS-CoV-2 的确切动物起源仍不清楚,了解其宿主范围对于防止种间传播至关重要。此前,我们评估了 SARS-CoV-2 在宠物、家畜、家禽和野生动物中的靶细胞谱。在此,我们将这项调查扩展到更广泛的动物物种和病毒,为大规模筛选潜在病毒宿主提供全面的来源。构建了几种哺乳动物物种(羊驼、仓鼠、刺猬、龙猫等)的单细胞图谱,以及不同谱系动物的肺、脑和外周血单核细胞 (PBMC) 的比较图谱,从中我们系统地分析了来自哺乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物和无脊椎动物的 20 多种 113 种病毒的病毒进入因子。还鉴定了保守的细胞连接组和调节组,揭示了这些物种之间的基本细胞-细胞和基因-基因串扰。总体而言,我们的研究可以帮助确定 SARS-CoV-2 和多种病毒的潜在宿主范围和组织嗜性,并揭示宿主-病毒共同进化的足迹。
Data type: Transcriptome or Gene expression
Sample scope: Multispecies
Submitter: 王浩宇(Haoyu Wang); BGI
Literatures
  1. PMID: 35917402
Release date: 2022-03-22
Last updated: 2021-08-03
Statistics: 53 samples; 53 experiments; 53 runs
Data size: 2.41TB