棘胸蛙皮肤转录组测序
Source: CNGBdb Project (ID CNP0001796)
Source: CNGBdb Project (ID CNP0001796)
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Project name: 棘胸蛙皮肤转录组测序初步揭示棘刺生成的分子机制
Description: 性成熟雄性棘胸蛙胸部皮肤上棘刺明显,为探究棘胸蛙棘刺形成的分子机制我们对成体以及亚成体雄性棘胸蛙胸部皮肤和成体雄性棘胸蛙腹部皮肤的三组样本进行了转录组测序。在对获得的100,312条Unigene进行注释分析后我们发现了26种与角蛋白合成相关基因,其中有3种在棘刺部位皮肤中呈现显著的差异表达。除此之外,在差异表达的基因中我们发现了与细胞增殖、性激素合成相关的基因,在KEGG代谢通路富集中发现多个差异表达基因富集与脂质代谢相关通路中。根据实验结果我们推测成体角蛋白基因表达的增加是棘刺出现的直接原因,此外脂质代谢的减弱可能导致了皮肤角质层中的脂类物质合成减少从而促使棘刺不明显化,与此同时,性激素合成相关的基因在亚成体到成体之间出现的表达差异说明棘胸蛙棘刺形成可能是由于性激素相关基因表达产物的影响,虽然本研究并未能加以证实,但可为之后的研究提供一定的思路。
Data type: Raw sequence reads
Sample scope: Monoisolate
Submitter: 蒋泽元(Zeyuan Jiang); 浙江师范大学
Release date: 2023-04-16
Last updated: 2021-04-19
DOI: 10.26036/CNP0001796
Data size: 8.14GB