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Description: 金粟兰目是被子植物生命之树上系统位置最重要的类群之一。尽管近年来植物基因组和转录组测序的极大进展,金粟兰的系统位置仍然没有得到解决,分化模式方面的研究也很匮乏。本项目拟通过对金粟兰Chloranthus spicatus 进行全基因组测序,以期填补这一知识空白。
研究基于金粟兰基因组,联合从被子植物主要分支挑选出的约224个已经发表的代表物种基因组,组成一个约225个物种的数据集。抽取单拷贝核基因和叶绿体基因组构建系统发育树,理清金粟兰在被子植物中的系统位置。此外,本项研究增加了木兰类全基因组的取样,有助于验证已有研究中木兰类与单双子叶植物分支的关系,为理解达尔文“恼人之谜”奠定基础。
Data type: Genome sequencing and assembly; Raw sequence reads; Genome sequencing; Assembly
Sample scope: Multiisolate
Submitter: dongming fang; BGI-zhenshen
Literatures
- PMID: 34836973
Release date: 2021-10-09
Last updated: 2021-10-09
DOI: 10.26036/CNP0001771
Data size: 624.18GB
