基于全基因组测序的被子植物系统进化研究
Source: CNGBdb Project (ID CNP0000269)
CC BY 4

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Description: 杜鹃花作为世界著名观赏植物,具有重要的科学、生态和经济价值。然而由于其经历了快速的辐射演化与频繁的自然杂交,给杜鹃花属植物准确的科学分类与物种鉴定带来了一定困难,这在一定程度上制约了我国杜鹃花资源的挖掘与利用。本研究通过对中国杜鹃花属6 个亚属85 个种的RAD-seq 高通量测序和基于这些数据的群体遗传学分析,探讨RAD-seq 技术在复杂类群分类与物种界定方面的优势。本研究中85 份材料比对到马缨杜鹃的平均比对率87.52%,在参考基因组上的平均覆盖度为5.21%,最终获得了620,423 个SNP 标记。初步的PCA、Structure 聚类及系统发育树的分析结果在亚属水平(杜鹃亚属、常绿杜鹃亚属、马银花亚属、羊踯躅亚属、映山红亚属和长蕊杜鹃亚属)基本支持目前形态学的分类处理,突出了鳞片在杜鹃属植物分类中的重要作用。
Data type: Raw sequence reads
Sample scope: Multiisolate
Submitter: 云飞 李; 华大农业应用研究院
Release date: 2019-01-01
Last updated: 2018-12-18
Statistics: 85 samples; 85 experiments; 85 runs
Data size: 25.33GB