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简介
脚本
输入
输出
louvain
简介

cluster cells into subgroups by louvain

脚本
输入
任务名称变量名称类型描述
*
      main
    project_nameString
      项目名称
    
*
      main
    anndataFile
      输入对象格式：anndata
    
*
      main.louvain
    use_weightsBoolean
      使用knn图中的权重
    
*
      main.louvain
    resolutionFloat
      对于默认风格“vtraag',您可以提供一个分辨率更高的分辨率意味着找到更多更小的集群,默认值为1.0.
    
*
      main.louvain
    memoryString
      任务运行的内存数量,注意1.取值范围为0.25核-32核,另外还可选48核和64,CPU必须为0.25核的整数倍;2.内存取值范围>为1GB-512GB,且内存必须为1GB的整数倍3.CPU/内存配比值必须在1:2到1:8之间
    
*
      main.louvain
    flavorString
      选择计算聚类的包的方法,可选值[‘vtraag’, ‘igraph’, ‘rapids’]
    
*
      main.louvain
    dockerString
      --
    
*
      main.louvain
    directedBoolean
      将邻接矩阵解释为有向图？
    
*
      main.louvain
    cpuString
      任务运行的CPU数量,注意1.取值范围为0.25核-32核,另外还可选48核和64,CPU必须为0.25核的整数倍;2.内存取值范围为1GB-512GB,且内存必须为1GB的整数倍3.CPU/内存配比值必须在1:2到1:8之间
    
输出
任务名称变量名称类型描述
*
      main
    clustfileFile
      通过填写 this.xxx将输出文件地址返回到对应表格 xxx 列
    
*
      main
    h5adfileFile
      通过填写 this.xxx将输出文件地址返回到对应表格 xxx 列