高通量测序数据信息采集标准
主要针对利用高通量测序技术产生的原始数据,例如全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)、重测序(Re-sequencing)、批量 RNA 测序、单细胞测序、时空转录组测序、时空蛋白转录组测序等。
标准框架介绍
完整的高通量测序数据采集流程,从样本到数据的规范化管理。
项目、样本说明
分模块独立采集项目、样本的信息,特别针对 STOmics 测序数据,需额外提供切片(Tissue Section)的信息,以及芯片 mask 文件等。
文库构建说明
标准化文库制备流程,包括片段化、接头拼接、PCR 扩增等步骤,确保文库质量与均一性保障。
上机测序说明
选择合适的测序平台与参数,根据检测需求确定测序策略、数据量和质量要求。
数据存储格式
数据格式说明,常见的数据格式有 fastq、bam。由于数据量较大,fastq 格式一般要求压缩。
高通量测序数据信息采集标准
测序数据质量指标
关键质量参数的标准要求,确保测序数据的可靠性和准确性
字段名称说明
Total Reads数据量规模,保障分析统计效力。
Average length序列平均长度。
Q30 (%)碱基质量,反映原始数据准确性。
GC Content (%)检查 AT / GC 偏差,避免数据偏好性。
Adapter Content接头污染比例,反映数据纯度。
Low Quality Reads (%)低质量读长占比。
Base pairs碱基数量。
采集模板下载
下载高通量测序数据信息采集模板,规范数据录入流程,确保信息完整准确。