AI
企业级部署
为生命科学领域量身定制的私有化 AI 智能体解决方案,让组织内的生物数据“开口说话”。

用户痛点
在生命科学研究与产业应用中,您可能正面临这些困境
数据价值沉睡
积累了海量基因组、表型、临床数据,但依赖传统数据库查询,非生信背景的研究者无法直接利用,数据价值难以释放。
分析流程僵化
标准分析流程(如基因功能注释、变异筛查)重复性高,但现有软件操作复杂,需要专业生信人员介入,响应速度慢,难以支撑业务快速决策。
安全合规焦虑
人类遗传数据、育种核心种质资源高度敏感,公有云分析平台存在数据泄露风险,但自建分析平台成本高、周期长。
知识传承断层
资深专家的领域经验(如特定疾病的变异解读规则、育种亲本选配逻辑)难以系统化沉淀,随着人员流动面临流失风险。
能解决的核心问题
BioAgent Studio 通过领域专用 AI 智能体,让组织内的生物数据“开口说话”
自然语言即查询
研究人员用日常语言提问(如“找出所有与抗旱相关的转录因子基因”),智能体自动理解意图并返回结构化结果,无需编写 SQL 或 Python。
专家经验数字化
将资深专家的分析逻辑、判断标准转化为智能体的决策规则,实现 7×24 小时在线的“数字专家”。
私有化安全部署
轻量级容器化部署在本地服务器,数据不出内网,满足《人类遗传资源管理条例》及企业数据安全要求。
多源异构整合
打通现有的 LIMS、育种管理系统、文献数据库,成为统一的数据查询与决策入口。
提供的服务
我们提供端到端的智能体构建服务,而非简单的软件销售
需求诊断与场景设计
业务场景梳理
识别高价值、高频次的重复性分析任务。
知识架构设计
构建领域知识图谱(疾病-基因-变异关联、作物-性状-分子标记映射)。
智能体开发与训练
基座模型选型:基于 BioGPT、GenePT 等生物领域大模型微调
工具链集成:对接 BLAST、HMMER、GATK 等本地分析软件
推理逻辑编排:设计多步骤分析工作流(如“变异检测→注释→致病性预测→报告生成”)
知识库构建与向量化
结构化知识导入
实验 protocol、内部标准操作手册、历史项目数据
文献知识抽取
自动解析领域最新文献,补充动态知识库
部署与集成
Docker 容器化交付
2 小时内完成本地部署。
系统对接
提供标准 API,嵌入现有业务系统(如育种管理系统、医院 HIS 系统)。
交付的产品
您将获得一套可独立运行的智能体软件系统
技术规格
部署环境
支持本地物理服务器、私有云(VMware / OpenStack)、信创环境(鲲鹏 / 飞腾)
硬件要求
最低 8 核 CPU / 32GB 内存 / 500GB 存储(可根据数据量扩展)
数据安全
支持国密算法加密、LDAP 统一认证、操作日志全追溯
组件说明
BioAgent Core 智能体推理引擎,支持多轮对话、工具调用、结果解释
Domain Knowledge Base 预置领域知识库(医学临床指南 / 作物基因组数据库 / 实验设计规范)
Analysis Plugins 本地化分析工具插件包(序列比对、变异注释、统计检验等)
Web Interface 简洁的 Web 交互界面,支持自然语言查询与结果可视化
Admin Console 管理后台,支持知识库更新、用户权限管理、使用审计日志
Deployment Package Docker Compose 配置文件 + 部署文档 + 初始化脚本
付费方式
采用一次性开发授权 + 年度知识服务订阅的模式
系统开发费
一次性
标准版:适用于单一应用场景,如仅遗传病解读或仅种质查询
专业版:多场景融合,支持复杂推理链与外部系统对接
定制开发:根据需求评估(特殊算法集成、私有化模型训练等)
年度服务费
订阅制
基础维护:系统更新、漏洞修复、远程技术支持
知识运营:知识库季度更新、新增文献自动同步、模型微调优化
增值服务
按需选购
额外知识库构建:按数据量计费
定制化培训:现场或远程培训服务
后续服务
持续进化保障
季度版本迭代
每季度推送功能更新包(新分析工具支持、界面优化)。
知识库保鲜
定期同步最新文献数据与公共数据库更新(如 ClinVar、Ensembl)。
远程技术支持
5×8 小时在线支持,紧急问题 4 小时内响应。
使用分析报告
年度提供用户使用数据分析,建议优化方向。
用户痛点
作为生物研究者,您是否经历过这些时刻
软件安装噩梦
为了做一个基因家族分析或单细胞亚群注释,先花两天配置 R 环境、安装 Seurat / Scanpy、解决依赖冲突,分析还没开始,热情已耗尽。
上游分析已完成,下游卡壳
测序公司返回了单细胞表达矩阵、宏基因组物种注释表,但想深入挖掘时,却被代码门槛阻隔——不会画 UMAP 分群图,不会做空间转录组的基因共定位分析。
重型平台过重
现有的云分析平台功能强大,但上传 10GB 单细胞数据慢、排队时间长,为了一个简单的细胞类型注释或 16S 多样性分析等待半小时,大材小用。
参数选择迷茫
面对单细胞聚类分辨率、宏基因组 Alpha 多样性指数、空间转录组聚类算法等选择,不确定参数含义,担心选错导致结论错误。
能解决的核心问题
DeepResearch 是专为组学数据下游轻量分析设计的在线工作台,专注处理 <100MB 的中间数据文件,填补“原始数据 heavy 分析”与“Excel 手工统计”之间的空白
上游免做,下游深耕
无需上传原始 FASTQ / BAM 文件,直接分析测序公司返回的表达矩阵、注释表格,专注生物学意义挖掘。
轻量单细胞 / 空转 / 宏基因组
支持中小规模单细胞数据(<5000 细胞)、16S / ITS 宏基因组结果、空间转录组 spot 级表达分析,3-5 分钟出图。
AI 辅助解读
智能推荐细胞类型标记、功能注释结果解释、空间表达模式描述,降低组学分析门槛。
结果直接可用
自动生成 Publication-ready 图表(UMAP、物种丰度圈、空间热图)与方法学描述。
提供的服务
传统序列分析(原功能)
基因家族鉴定与结构域可视化、多序列比对与进化树构建、启动子顺式元件分析。
单细胞转录组轻量分析(下游分析专用)
细胞亚群探索:上传 10x Genomics 标准输出(barcodes.tsv / features.tsv / matrix.mtx,压缩后<50MB),在线完成降维、聚类、UMAP / t-SNE 可视化
Marker 基因分析:一键计算组间差异基因,自动生成细胞类型注释建议(基于公共数据库匹配)
功能富集:针对特定亚群进行 GO / KEGG 富集(轻量算法,<1000 个细胞快速响应)
拟时序分析:支持 Monocle2 简化流程,生成细胞分化轨迹图(适用于明确的分支线,如骨髓分化)
明确边界:不支持原始 FASTQ 比对(Cell Ranger 流程),不支持 >10000 细胞的大型数据集,不支持 TCR / BCR 克隆分析
宏基因组轻量分析(基于注释结果)
16S / ITS 下游分析:上传 OTU / ASV 表格,完成 Alpha 多样性(Chao1、Shannon、Simpson)、Beta 多样性(PCoA / NMDS)、LEfSe 差异物种分析
宏基因组物种组成:基于物种注释表(metaphlan2 / kraken2 输出),绘制物种丰度柱状图、Circos 圈图、功能基因丰度热图
功能预测:基于 16S 数据的 PICRUSt2 功能预测结果可视化(KEGG 通路丰度比较)
样本比较:多组间物种差异统计(Welch's t-test、Mann-Whitney U)
明确边界:不支持原始图像处理(spaceranger count 流程),不支持多切片对齐,不支持三维重建
空间转录组轻量分析(基于矩阵分析)
基因空间表达可视化:上传 Space Ranger 输出的表达矩阵(filtered_feature_bc_matrix),绘制特定基因的空间表达热图、Violin 图
空间聚类解读:基于 Seurat 空间聚类结果,分析不同空间区域(如肿瘤边缘 vs 核心)的 marker 基因
细胞共定位:分析配体-受体对的空间共表达模式(基于预先计算的 ligand-receptor 数据库)
形态学关联:上传 HE 染色 spot 标记信息,关联病理区域与基因表达特征
明确边界:不支持原始图像处理(spaceranger count 流程),不支持多切片对齐,不支持三维重建
AI 研究助手
单细胞智能注释:自动识别 marker 基因组合,推荐细胞类型(如“Cluster 0 高表达 IL7R 和 CD3D,推测为 CD4 T cell”)
宏基因组生态解读:解释 Alpha 多样性差异的生物学意义(如“Shannon 指数降低提示菌群多样性受损,可能与抗生素使用相关”)
空间模式描述:自动生成基因空间分布描述(如“该基因在肿瘤-基质交界区呈现显著高表达,提示微环境调控作用”)
参数智能推荐:根据数据规模推荐最佳聚类分辨率(单细胞)、距离算法(宏基因组)、空间权重参数(空转)
知识支持
单细胞分析最佳实践库
分辨率选择指南、批次效应简易处理。
宏基因组常见菌群功能数据库
益生菌、致病菌、功能基因注释。
空间转录组 spot 解读案例
肿瘤微环境、发育生物学场景。
交付的产品
DeepResearch 在线平台(Web 端访问,无需安装 R / Python)
核心功能模块
Analysis Hub:分模块入口(Single Cell / Metagenomics / Spatial / General)
单细胞模块:拖拽上传 mtx / tsv 文件,选择物种(人 / 小鼠 / 其他),一键运行降维聚类
宏基因组模块:支持 BIOM 格式、CSV 格式 OTU 表,自动识别分类层级(门 / 纲 / 目 / 科 / 属 / 种)
空间转录组模块:上传矩阵 + 坐标文件,交互式浏览空间表达图谱
AI Copilot:侧边栏实时解释分析结果(如“为什么我的单细胞聚类出现批次效应?”、“这个 PCoA 图怎么解读?”)
Visualization Studio:交互式图表编辑
单细胞:UMAP 分群着色调整、Marker 基因气泡图、拟时序曲线美化
宏基因组:丰度图调色、多样性箱线图组间比较、LEfSe cladogram 生成
空间转录组:空间切片模拟图、基因共表达散点图
Report Generator:一键导出分析报告
PDF / Word 格式,包含方法学(如“使用 Seurat v4 进行标准分析……”)与结果描述。
技术特点
数据输入限制:仅接受 <100MB 的处理后数据(表达矩阵、注释表格),明确拒绝原始 FASTQ / BAM(引导至重型平台)
计算限制:单任务内存 ≤16GB,运行时间 ≤30 分钟(适合 5000 细胞以内单细胞、<200 样本宏基因组)
格式兼容:支持 10x Genomics、Scanpy、Seurat、QIIME2、Space Ranger 标准输出格式
数据安全:任务完成后 24 小时自动清理服务器缓存,支持立即手动删除
付费方式
灵活订阅,按需升级
版本月费年费(省 20%)核心权益
Free¥0¥0基础工具 + 单细胞 / 宏基因组 / 空转:各 3 次 / 月体验 + 每日 3 次 AI 助手
Basic¥79¥760 全功能开放(含三类组学下游分析)+ 每日 20 次 AI 助手 + 30GB 存储 + 优先队列
Pro¥299¥2,870 批量处理(单细胞 ≤5000 细胞不限次数、宏基因组 ≤200 样本)+ 无限 AI 助手 + 150GB 存储 + API 接口
Team-¥12,900 / 年(10 人)团队共享空间(1TB)+ 私有分析流程保存 + 管理员后台
按需算力包(所有版本通用)
  • 基础订阅包含每月 200 核时额度(约支持 100 次单细胞聚类或 200 次多样性分析)
  • 超出部分:¥0.6 / 核时
  • 大内存临时包:¥30 /次(临时扩容至 32GB 内存,支持 5000-10000 细胞分析)
  • 教育优惠:高校课题组凭机构邮箱申请 Pro 版 5 折(¥150 / 月)。
后续服务
持续优化体验
月度功能更新:每月新增 1 个组学分析小工具(如本月新增“单细胞细胞通讯分析(CellChat 轻量版)”)
AI 模型升级:持续优化细胞类型注释准确度、空间模式识别能力
模板市场:用户可分享自定义分析模板(如“肠道菌群 16S 标准分析流程”),被采用可获积分抵扣订阅费
数据持久化:Pro 以上版本支持长期保存分析项目,随时回溯修改参数重跑
增值服务
分析报告定制:由专业生信分析师审核并润色分析报告,提升发表质量
数据预处理:将原始数据转换为平台可接受的格式(如 FASTQ→表达矩阵)
专属分析模板:根据课题组特定需求定制分析流程模板
产品定位与边界说明
采用一次性开发授权 + 年度知识服务订阅的模式
DeepResearch 不做(请使用我们的重型生信分析平台)
单细胞原始数据处理:Cell Ranger 比对、去噪、双细胞剔除(这些产生大文件的上游步骤)
宏基因组原始数据处理:Reads 质控、组装、基因预测、MAG 分箱(计算密集型)
空间转录组原始数据处理:图像配准、spot 定位、多切片对齐(需要图像计算资源)
长期云存储:>1GB 的数据集长期托管
DeepResearch 专注(轻量下游分析)
单细胞:基于已有表达矩阵的降维、聚类、注释、可视化(<5000 细胞)
宏基因组:基于注释表的多样性统计、差异分析、功能可视化(16S / 宏基因组物种表)
空间转录组:基于 Space Ranger 输出的空间表达可视化、区域差异分析(<1000 spots)
两款产品协同:当您的原始数据需要质控、比对、定量时,请使用我们的姊妹重型平台;当这些上游分析完成,需要进行下游轻量挖掘、快速出图、AI 辅助解读时,DeepResearch 是您的最佳选择。